Abaixo um exemplo de como redirecionar toda a comunicação da porta 54 para a 53.
iptables -t nat -I PREROUTING -p tcp --dport 54 -j REDIRECT --to-port 53
iptables -t nat -I PREROUTING -p udp --dport 54 -j REDIRECT --to-port 53
iptables -I INPUT -p tcp --dport 53 -j ACCEPT
iptables -I INPUT -p udp --dport 53 -j ACCEPT