É possível ignorar localmente alterações ocorridas em arquivos sobre controle do GIT temporariamente. Deste modo, o(s) arquivo(s) modificado não será listado como status ‘modificado’.
Para isto ignorar, basta:
git update-index --assume-unchanged <file>
Para reverter esta alteração para ignorar, basta:
git update-index --no-assume-unchanged <file>